Google
      
发新话题
打印

[量化计算] 关于cpmd的几个问题,望各位达人指点迷津,谢谢!

本主题由 homeboy 于 2008-5-13 18:32 解除高亮

关于cpmd的几个问题,望各位达人指点迷津,谢谢!

问题1
见manual中指出不同类型赝势的cutoff值:VDB(20-40 ry), MT(60-100 ry), GO (80-200 ry)
那么如果我选取的cutoff值如果低于相应的范围,能不能给出正确的结果(粗略即可),因为考虑到计算时间问题。
因为在计算中碰到: ODIIS| Insufficient progress; reset! 这个问题,如果提高cutoff的值就ok了
问题2
从cpmd网站上download的赝势文件,有一部分元素的某种赝是找不到,请问到哪里可以下载到,或者说应该怎样产生。
问题3
我们选定一个box为的是考虑体系的周期性,也就是要考虑周围原子的影响,但cpmd中有一isolated的选项,我很是不理解,我始终认为,只有box选得很大,而分子放入box中心时,这样才有可能忽略周期性的影响。总之我isolated选项我始终不能理解

-----可能都是些很菜的问题,请各位包容指点~

TOP

怎么没有人回答呢~
俺困惑啊!
面朝电脑,迅速衰老。

TOP

关于cutoff,我也不太敢确定,我选的cutoff很小,否则要算很久,由于也只是练手,所以不敢多说什么
其次,关于赝势函数,都是已有的算好的文件,你可以google一下,或者发上来,看看谁有给你传一个就好了
最后,关于isolated系统,这种是存在的,比如说一个生物分子,或者DNA什么的,在一个环境中模拟,都会存在的,不过isolate系统的计算会增加计算量。

[ 本帖最后由 muyunfei 于 2008-5-13 15:17 编辑 ]

TOP

1)新手报到请去新手上路版
2)cutoff取小了,影响的不只是精度问题
3)cpmd mailinglist搜索您要的赝势
4)isolated即真空模拟,这时候box没什么太大意义了
为避免资源重复,发贴前请先搜素论坛
请多发好贴,多参加讨论交流
学术交流,灌水者请自重,K ID绝不手软
分子模拟论坛

TOP

很高兴终于有人回答了~~
1)新手报到请去新手上路版------收到:$
2)对于cutoff的取值,像SG一类赝势一般取多大时计算结果才可信呢
不知cpmd mailinglist怎么回事,我注册过几次都没得到confirm,不知大家有没有Na_MT_BLYP和Mg_MT_BLYP,如果有可否传给我一份s0701868@mailserv.cuhk.edu.hk
面朝电脑,迅速衰老。

TOP

Sodium is not an easy to handle element, specifically if you want to look at Na+ ions. in that case you will most likely need the Na_SEMI_BLYP, which is a semi-core potential and a rather high plane wave cutoff due to the hardness of the potential.

In principle, you should be mix and match all kinds of pseudopotentials, but some functionality in CPMD is not implemented for all types, so you only get the common denominator.
为避免资源重复,发贴前请先搜素论坛
请多发好贴,多参加讨论交流
学术交流,灌水者请自重,K ID绝不手软
分子模拟论坛

TOP

感谢各位的回答和好心人的赝势!
面朝电脑,迅速衰老。

TOP

赞助商链接

论坛之星

发新话题